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Portraits {-}

Auteurs {-}

Ce livre a été rédigé de manière collaborative par plusieurs auteurs. Qui sont-ils ?

Loïc Desquilbet {-}

Enseignant-chercheur en biostatistique et en épidémiologie clinique à l’Ecole Nationale Vétérinaire d’Alfort, Loïc Desquilbet travaille dans le domaine de la recherche clinique vétérinaire, incluant la validation de méthodes de mesure (répétabilité, reproductibilité, et concordance de méthodes). Il travaille sur SAS et a conçu une macro SAS pour prendre en compte les variables quantitatives dans un modèle multivarié. Ses enseignements visent à former les étudiants à l’analyse critique d’articles.

Boris Hejblum {-}

Enseignant-chercheur en biostatistique à l’Institut de Santé Publique d'Épidémiologie et de Développement (ISPED, Université de Bordeaux), Boris Hejblum est membre de l’équipe SISTM dans le centre Inserm U1219 Bordeaux Population Health et Inria Bordeaux Sud-Ouest.

Il travaille sur l’analyse de données biomédicales répétées de grande dimension, en particulier la statistique génomique dans le cadre de la recherche vaccinale ainsi que sur le traitement de dossiers médicaux informatisés par des approches de machine learning. Il développe de nouvelles méthodologies statistiques implémentées sous forme de paquets R open-source permettant leur réutilisation, et la reproductibilité des résultats de ses publications.

Arnaud Legrand {-}

Chercheur au Laboratoire d'informatique de Grenoble, Arnaud Legrand pilote l'équipe Polaris (Inria). Il s'est spécialisé dans l'évaluation (simulation, observation, statistiques, analyse de traces) et l'optimisation de performance de grandes infrastructures de calcul (supercalculateurs, grille, calcul bénévole, clouds, …). L’axe optimisation de ses travaux porte sur la proposition ou l’évaluation de méthodes souvent sophistiquées et où il est important de conserver tous les détails pour comprendre leur performance et comment les améliorer. Arnaud Legrand co-pilote le Mooc "Recherche reproductible".

Pascal Pernot {-}

Physico-chimiste et directeur de recherches au CNRS, Pascal Pernot travaille au Laboratoire de Chimie Physique à l'Université Paris-Sud. Ses thématiques principales sont la gestion des incertitudes en modélisation physico-chimique, et notamment la quantification des incertitudes de prédiction des méthodes de chimie quantique et moléculaire. Il assure des formations en lien avec les méthodes standardisées de propagation des incertitudes. Il utilise l’environnement Rstudio/Github/Zenodo pour accompagner ses publications des données et codes nécessaires à la reproduction des résultats.

Nicolas Rougier {-}

Chercheur à l'Inria, Nicolas P. Rougier est membre de l'équipe Mnemosyne project dont l'approche se situe à la frontière entre les neurosciences intégratives et computationnelles en association avec l'Institut des maladies neurodégénératives, le Laboratoire Bordelais de Recherche en Informatique, l'Université de Bordeaux et le CNRS. En 2015, il a co-fondé avec Konrad Hinsen, la revue ReScience spécialisée dans la publication d'études de réplication computationnelles. Il anime régulièrement des formations pour des doctorants, des chercheurs, des ingénieurs.

Facilitatrice {-}

Elisa de Castro Guerra, ActivDesign {-}

Formatrice à Activdesign et présidente de Floss Manuals Francophone, Elisa de Castro Guerra est spécialisée en création numérique et web. Elle travaille sur le développement d’applications web depuis plusieurs années. E. de Castro Guerra milite pour l’utilisation des logiciels libres, en particulier par la facilitation d’écriture de documentations en langue française. E. de Castro Guerra anime ainsi régulièrement des book sprints pour des associations, des entreprises.

Coordinatrice du projet {-}

Sabrina Granger {-}

Docteur en langue et littérature françaises, Sabrina Granger est conservatrice des bibliothèques à l'Unité Régionale de Formation à l'Information Scientifique et Technique de Bordeaux. Ses différents postes l’ont amenée à travailler dans les domaines de l’informatique documentaire, la communication en BU et les services aux chercheurs. S. Granger est co-pilote du collège « Compétences et formations » du Comité pour la Science Ouverte.

Contributeurs de la 1re édition {-}

Ils ont participé à différentes étapes du book sprint :

  • Martine Courbin-Coulaud, documentaliste, Information et Edition Scientifique, Centre de recherche Inria Bordeaux Sud-Ouest

  • Ludovic Duvaux, bio-informaticien, Unité Mixte de Recherche "Biogeco", Inra

  • Pierre Gravier, conservateur des bibliothèques, Direction de la documentation, Université de Bordeaux

  • Grégoire Le Campion, ingénieur en traitement et analyse de données, Unité Mixte de Recherche "Passages", CNRS

  • Solenne Roux, ingénieure en traitement et analyse de données, Equipe d'Accueil "Laboratoire de Psychologie", Université de Bordeaux

  • Frédéric Santos, statisticien, Unité Mixte de Recherche "Pacea", CNRS

Contribuer {-}

Vous aussi lecteurs, vous pouvez contribuer, poser des questions :

  • en créant une issue dans l'entrepôt GitHub de l'ouvrage
  • en envoyant un message à [email protected]

Remerciements {-}

Sincères remerciements à Isabelle Scarpat-Bouvet pour son implication dans l'organisation du projet.